Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpr88Q9EPB7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms