Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aph1cQ9DCZ9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aph1cQ9DCZ9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms