Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmgn3Q9DCB1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms