Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpraQ9DBG7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms