Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg9Q9DB90 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg9Q9DB90 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms