Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf4Q9DAW6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpf4Q9DAW6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms