Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp12Q9D9M2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp12Q9D9M2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms