Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms