Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh4Q9D8F1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh4Q9D8F1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms