Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chmp4bQ9D8B3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms