Protein–RNA interactions for Protein: Q9D701

Upk3bl1, Uroplakin-3b-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bl1Q9D701 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Upk3bl1Q9D701 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk3bl1Q9D701 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms