Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fam227bQ9D518 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam227bQ9D518 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms