Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cul2Q9D4H8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms