Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4933428M09RikQ9D3X3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4933428M09RikQ9D3X3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms