Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rufy3Q9D394 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rufy3Q9D394 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms