Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chordc1Q9D1P4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chordc1Q9D1P4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms