Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl53Q9D1H8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms