Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Syf2Q9D198 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Syf2Q9D198 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms