Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mdm1Q9D067 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms