Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Shisa9Q9CZN4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Shisa9Q9CZN4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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