Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Utp11Q9CZJ1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Utp11Q9CZJ1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms