Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hcfc1r1Q9CYQ5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms