Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2fQ9CY34 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2fQ9CY34 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms