Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sgo1Q9CXH7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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