Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Sft2d3Q9CSV6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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