Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rprd1bQ9CSU0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms