Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc2Q9CQP2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc2Q9CQP2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2Q9CQP2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms