Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN4

Sostdc1, Sclerostin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sostdc1Q9CQN4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sostdc1Q9CQN4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms