Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQ90 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQ90 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQ90 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQ90 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CQ90 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9CQ90 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q9CQ90 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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