Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itgb3bpQ9CQ82 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Itgb3bpQ9CQ82 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms