Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mid1ip1Q9CQ20 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mid1ip1Q9CQ20 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mid1ip1Q9CQ20 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mid1ip1Q9CQ20 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mid1ip1Q9CQ20 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mid1ip1Q9CQ20 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mid1ip1Q9CQ20 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mid1ip1Q9CQ20 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid1ip1Q9CQ20 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mid1ip1Q9CQ20 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms