Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lrrc18Q9CQ07 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lrrc18Q9CQ07 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms