Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ska1Q9CPV1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms