Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpl17Q9CPR4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl17Q9CPR4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms