Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Scd3Q99PL7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scd3Q99PL7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms