Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rtn4rQ99PI8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rtn4rQ99PI8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms