Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lpin3Q99PI4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lpin3Q99PI4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms