Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SrrtQ99MR6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SrrtQ99MR6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms