Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chmp1b1Q99LU0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chmp1b1Q99LU0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms