Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf19Q99KP6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf19Q99KP6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf19Q99KP6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf19Q99KP6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf19Q99KP6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf19Q99KP6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf19Q99KP6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf19Q99KP6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf19Q99KP6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf19Q99KP6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf19Q99KP6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms