Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clint1Q99KN9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms