Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl22Q99JN2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms