Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin3Q99JB8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms