Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SptssbQ925E8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms