Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nrif1Q923B3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms