Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usb1Q91W78 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms