Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cabp4Q8VHC5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cabp4Q8VHC5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms