Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SelenomQ8VHC3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms