Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE28

Nkd2, Protein naked cuticle homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd2Q8VE28 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd2Q8VE28 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd2Q8VE28 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd2Q8VE28 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd2Q8VE28 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkd2Q8VE28 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nkd2Q8VE28 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms