Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc92Q8VDN4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms